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          深圳華大聯(lián)合多家機構(gòu)發(fā)布全球首批生命時空圖譜

          2022年05月06日 11:44   來源:經(jīng)濟日報新聞客戶端   

            5月5日,時空組學(xué)聯(lián)盟啟動暨首期專輯成果發(fā)布會在深圳舉行。深圳華大生命科學(xué)研究院聯(lián)合多家機構(gòu)在Cell出版社官網(wǎng)以時空組學(xué)聯(lián)盟(STOC)專題的形式發(fā)布了全球首批生命時空圖譜。據(jù)悉,這是首次從時間和空間維度上對生命發(fā)育過程中的基因和細胞變化過程進行超高精度解析,為認知器官結(jié)構(gòu)、生命發(fā)育、人類疾病和物種演化提供全新方向。

            據(jù)了解,研究人員利用華大自主研發(fā)的時空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq,首次繪制了小鼠、斑馬魚、果蠅、擬南芥四種模式生物胚胎發(fā)育或器官的時空圖譜。其中,利用高精度大視場Stereo-seq技術(shù)繪制的小鼠胚胎發(fā)育時空圖譜相關(guān)成果在《細胞》(Cell)期刊在線發(fā)表,斑馬魚、果蠅、擬南芥時空圖譜相關(guān)成果在《細胞》子刊《發(fā)育細胞》(Developmental Cell)在線發(fā)表。該系列研究由深圳華大生命科學(xué)研究院聯(lián)合中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院、南方科技大學(xué)、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)等來自6個國家的32個科研團隊共同參與完成。

            科學(xué)的發(fā)展離不開工具進步。17世紀,人類通過顯微鏡第一次看到了生命的微觀結(jié)構(gòu)——細胞;20世紀,DNA測序技術(shù)讓科學(xué)家第一次解析了生命大分子——DNA。如今,Stereo-seq技術(shù)不僅可以精確地了解每個細胞內(nèi)的分子表達,還能定位該細胞的空間位置。《細胞》論文第一作者、深圳華大生命科學(xué)研究院時空組學(xué)首席科學(xué)家陳奧表示,通過Stereo-seq技術(shù),人類首次以500納米的空間分辨率實現(xiàn)了生命全景時空圖譜的繪制。在過去,要做幾千甚至上萬次的實驗才能完成的時空圖譜;現(xiàn)在,在華大自主研發(fā)的時空芯片上,只需一次定位就能實現(xiàn)。這是生命科學(xué)工具的里程碑式突破。

            “時空組學(xué)技術(shù)的出現(xiàn),實現(xiàn)了生命在時間和空間維度上細胞‘地圖’的全面繪制,讓我們可以在細胞甚至亞細胞分辨率下,觀察到正常狀態(tài)和疾病狀態(tài)下分子和細胞的分布及細胞之間的互作情況,真正實現(xiàn)了從高精度結(jié)構(gòu)的角度去理解功能,這將大大推動我們對于生命復(fù)雜性和人類疾病的全面認知。”系列論文的共同通訊作者之一、深圳華大生命科學(xué)研究院單細胞組學(xué)首席科學(xué)家劉龍奇表示。

            “得益于Stereo-seq技術(shù)的超大視野,科研人員可以在發(fā)育中的小鼠胚胎上以非常高的分辨率和測序深度進行組織的分析和研究。” 時空聯(lián)盟成員、《細胞》論文共同作者、英國劍橋大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院院長Patrick Maxwell教授表示,利用本研究免費公開的數(shù)據(jù),大家可以真正地理解哺乳動物是如何發(fā)育的,組織是如何組成的等問題。這也將使我們深入了解發(fā)育的過程、正常的組織功能,以及疾病。

            與會同期,時空組學(xué)聯(lián)盟(STOC)宣布成立,旨在推動時空組學(xué)技術(shù)在生命科學(xué)各個領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用,繪制人類器官、疾病、發(fā)育、演化等時空圖譜,目前已有80多位科學(xué)家加入。

            時空組學(xué)聯(lián)盟成員、中國科學(xué)院院士、中科院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心主任蒲慕明表示,過去10年、20年間出現(xiàn)的各類組學(xué)所產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù)都缺少時空信息,而時空信息的收集、分析、建模等大量工作,需要生物學(xué)、計算機、數(shù)學(xué)、工程學(xué)等多領(lǐng)域的人才加入,需要很多單位共同參與完成。

          (責(zé)任編輯:張雪)

          深圳華大聯(lián)合多家機構(gòu)發(fā)布全球首批生命時空圖譜

          2022-05-06 11:44 來源:經(jīng)濟日報新聞客戶端
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